Das NIHK und das Museum für Archäologie Schloss Gottorf (Schleswig) können auf eine lange Geschichte einer intensiven und erfolgreichen Zusammenarbeit zurückblicken. Diese reicht bis in die 1960er Jahre zurück, als entschieden wurde, bei der Erforschung frühgeschichtlicher Siedlungen in den Küstenräumen Schleswig-Holsteins und Niedersachsens eng zusammenzuarbeiten. In der Folge wurden die archäobotanischen Forschungen an Fundstellen wie Elisenhof oder Haithabu in Wilhelmshaven durchgeführt, während die u.a. bei den Ausgrabungen im Bereich der Wurt Feddersen Wierde geborgenen Tierknochen von den Schleswiger Experten archäozoologisch analysiert wurden. Diese Kooperation wurde nun erneuert und erweitert, um die in beiden Häusern vorhandene Expertise und Ausstattung bestmöglich nutzbar zu machen. Es wurde vereinbart, dass die in Schloss Gottorf beheimatete Restaurierungswerkstatt unter Leitung von Dr. J. Schultze zukünftig auch die Konservierung von Nassholzfunden aus den Ausgrabungen des NIhK vornimmt, während die Textilarchäologin des NIhK C. Peek, M.A., Analysen an organischem Fundmaterial aus Schleswig-Holstein durchführt. Darüber hinaus berät sie das Schleswiger Landesmuseum bei der Konservierung und Ausstellung entsprechender Objekte.